吸烟者为现在使囊性纤维化患者患病的细菌提供了家园

吸烟真的会阻塞肺部，即使是那些从未接触过香烟

的人。事实证明，20世纪初的吸烟习惯仍然对囊性纤维化患者造成损害，而不是对烟草使用者或其家人造成损害。

囊性纤维化（CF）是一种遗传性疾病，使患者的粘液粘稠。它们的肺部成为细菌的繁殖地，健康人的免疫系统很容易打败这些细菌。CF患者经常服用抗生素来预防肺部感染，但抗生素并不能杀死一切。一种名为脓肿分枝杆菌（M.pusculusus）的细菌对许多常见药物具有耐药性，在过去几十年中，它已成为CF社区的一种瘟疫。

几年前，科学家开始研究鼠疫是如何起源的。通过分析从世界各地收集的脓肿分枝杆菌基因组，研究人员追踪了该细菌在上个世纪的传播。他们发现，早在20世纪50年代医学进步让CF患者度过婴儿期之前的几十年里，脓肿分枝杆菌已经在全球传播，这要归咎于一个老的公共卫生敌人。吸烟者的肺部形成了一个病原体能够生存和繁殖的蓄水池，当囊性纤维化患者开始步入成年后，蓄水池迅速溢出。

要实现这一出乎意料的联系，需要对来自世界各地的数千株脓肿分枝杆菌菌株的完整基因组进行测序，而没有参与这项研究的科学家们表示，他们的努力是有回报的。

挪威公共卫生研究所传染病研究人员Vegard Eldholm说：“这一发现非常清楚。”。

“这是一篇非常酷的论文，”爱丁堡大学分子流行病学家Verity Hill说。“真的很优雅，而且考虑得很周到。”

推翻教条

科学家过去认为脓肿分枝杆菌大部分时间都生活在环境中，肺受损的人在接触污染的土壤或水时会感染。五年前，传染病研究人员朱利安·帕克希尔（Julian Parkhill）和安德烈斯·弗洛托（Andres Floto）领导的一个小组证明脓肿分枝杆菌可以从一个患有CF的人传播到另一个患有CF的人，CF治疗中心是传播的温床，这一信条改变了。

结果出人意料。当时，研究人员对脓肿支原体的遗传学知之甚少。Parkhill和Floto着手对在一个CF中心接受治疗的人身上发现的脓肿分枝杆菌菌株的基因组进行排序，看看他们会发现多少变异，以及这种基因变异是否与毒力相关。他们假设每个感染者都是独立地从环境中感染病原体的，因此基因组会有很大的差异。相反，许多基因组相似甚至完全相同。帕克希尔说：“我们非常惊讶地发现，有确凿的证据表明，这些患者相互传播了艾滋病。”。

但并非所有脓肿支原体感染都可以通过治疗中心内的传播来解释。有些基因组与从环境中提取的基因组太相似，但与从中心的其他人直接获取的基因组太不同。那么它们起源于哪里呢？

更大的研究

帕克希尔说：“任何问题的答案总是更多的数据。”。他的团队对从全世界1000多人中分离出的脓肿支原体菌株的基因组进行了测序，其中一些人患有CF，另一些人患有其他类型的肺损伤，以了解病原体是如何传播的。

希尔说，有了一船基因序列，“你就可以建立一个基本上是家谱的东西。”他使用类似的技术来追踪病毒的传播。基因相似的细菌组合在一起，比如兄弟姐妹如何占据家谱的同一分支。通过了解脓肿分枝杆菌基因组获得新突变的频率，研究人员可以在树上添加日期。